Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SOBPA7XYQ1 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
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