Protein–RNA interactions for Protein: A6NNM8

TTLL13P, Tubulin polyglutamylase TTLL13P, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL13PA6NNM8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TTLL13PA6NNM8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TTLL13PA6NNM8 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms