Protein–RNA interactions for Protein: A6NK53

ZNF233, Zinc finger protein 233, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF233A6NK53 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZNF233A6NK53 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZNF233A6NK53 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms