Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW0

USP17L3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L3A6NCW0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
USP17L3A6NCW0 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
USP17L3A6NCW0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms