Protein–RNA interactions for Protein: V9GYH0

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYH0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
V9GYH0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
V9GYH0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
V9GYH0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
V9GYH0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
V9GYH0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V9GYH0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V9GYH0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V9GYH0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V9GYH0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
V9GYH0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms