Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ARL2-SNX15V9GYD0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ARL2-SNX15V9GYD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms