Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
U3KQE9 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
U3KQE9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
U3KQE9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
U3KQE9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
U3KQE9 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
U3KQE9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms