Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms