Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y561

LRP12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP12Q9Y561 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
LRP12Q9Y561 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LRP12Q9Y561 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms