Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TRAF6Q9Y4K3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TRAF6Q9Y4K3 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms