Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4E8

USP15, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 15, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15Q9Y4E8 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
USP15Q9Y4E8 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
USP15Q9Y4E8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms