Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Q9Y3F1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Q9Y3F1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms