Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
NINLQ9Y2I6 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NINLQ9Y2I6 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms