Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TRAPPC4Q9Y296 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TRAPPC4Q9Y296 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms