Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y248

GINS2, DNA replication complex GINS protein PSF2, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS2Q9Y248 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GINS2Q9Y248 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GINS2Q9Y248 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms