Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
SHOC2Q9UQ13 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SHOC2Q9UQ13 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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