Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP38

FZD1, Frizzled-1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD1Q9UP38 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FZD1Q9UP38 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
FZD1Q9UP38 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms