Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNL2

SSR3, Translocon-associated protein subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR3Q9UNL2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SSR3Q9UNL2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SSR3Q9UNL2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms