Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CAPN11Q9UMQ6 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CAPN11Q9UMQ6 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms