Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT5

FBXO4, F-box only protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO4Q9UKT5 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
FBXO4Q9UKT5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FBXO4Q9UKT5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms