Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR8

TSPAN16, Tetraspanin-16, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN16Q9UKR8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
TSPAN16Q9UKR8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TSPAN16Q9UKR8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms