Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJD2Q9UKL4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJD2Q9UKL4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms