Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
USP21Q9UK80 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
USP21Q9UK80 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms