Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RIMS3Q9UJD0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
RIMS3Q9UJD0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms