Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
PLXNA1Q9UIW2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PLXNA1Q9UIW2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms