Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CTNNA3Q9UI47 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CTNNA3Q9UI47 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CTNNA3Q9UI47 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms