Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

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Length 88 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SMPXQ9UHP9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms