Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHM6

OPN4, Melanopsin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN4Q9UHM6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
OPN4Q9UHM6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms