Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHI6

DDX20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX20Q9UHI6 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
DDX20Q9UHI6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DDX20Q9UHI6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DDX20Q9UHI6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms