Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB7

AFF4, AF4/FMR2 family member 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFF4Q9UHB7 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AFF4Q9UHB7 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms