Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LRP2BPQ9P2M1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRP2BPQ9P2M1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms