Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2D1

CHD7, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 2,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD7Q9P2D1 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CHD7Q9P2D1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHD7Q9P2D1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms