Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU5

LMCD1, LIM and cysteine-rich domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1Q9NZU5 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LMCD1Q9NZU5 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LMCD1Q9NZU5 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms