Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM1

MYOF, Myoferlin, humanhuman

Predictions only

Length 2,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOFQ9NZM1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYOFQ9NZM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MYOFQ9NZM1 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms