Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SPG21Q9NZD8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SPG21Q9NZD8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms