Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ71

RTEL1, Regulator of telomere elongation helicase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1Q9NZ71 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RTEL1Q9NZ71 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RTEL1Q9NZ71 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms