Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MIS18AQ9NYP9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MIS18AQ9NYP9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms