Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ALKBH4Q9NXW9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ALKBH4Q9NXW9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms