Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
MS4A12Q9NXJ0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
MS4A12Q9NXJ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms