Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX52

RHBDL2, Rhomboid-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL2Q9NX52 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RHBDL2Q9NX52 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RHBDL2Q9NX52 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms