Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM30AQ9NV96 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMEM30AQ9NV96 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms