Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GINM1Q9NU53 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GINM1Q9NU53 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms