Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP8A2Q9NTI2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP8A2Q9NTI2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms