Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSN8

SNTG1, Gamma-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTG1Q9NSN8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SNTG1Q9NSN8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SNTG1Q9NSN8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms