Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCND1Q9NSA2 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCND1Q9NSA2 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCND1Q9NSA2 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCND1Q9NSA2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms