Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS64

RPRM, Protein reprimo, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRMQ9NS64 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPRMQ9NS64 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms