Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
LTBP3Q9NS15 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP3Q9NS15 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
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