Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VPS45Q9NRW7 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VPS45Q9NRW7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms