Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ4

TULP4, Tubby-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP4Q9NRJ4 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TULP4Q9NRJ4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TULP4Q9NRJ4 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms