Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CNGB3Q9NQW8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CNGB3Q9NQW8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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